
LMA e SMD são cânceres do sangue que minam a capacidade do corpo de produzir células sanguíneas saudáveis. Embora pesquisas anteriores tenham identificado os papéis de vários genes individuais nessas doenças e seus subtipos, o novo estudo é o primeiro a fazer uma abordagem imparcial em todo o genoma para iluminar as ligações entre os genes, a expressão do gene, a forma física das células cancerosas, e resultados do paciente.
“Tratar essas doenças é um desafio porque os subtipos apresentam características diferentes”, disse a principal autora do estudo, Ilaria Iacobucci, PhD, de St. Jude Children's Research Hospital. “Nosso estudo fornece uma compreensão muito mais rica desses subtipos, semelhante a um dicionário de todas as alterações genômicas. Também ressalta o valor de ter informações genômicas abrangentes no início do tratamento para remover a incerteza e ajudar os médicos a entender melhor a perspectiva do paciente ”.
The researchers analyzed blood and bone marrow samples from 598 adults with AML and 706 adults with MDS. In addition to sequencing all DNA, they also sequenced RNA, an indicator of which genes are being actively expressed and which are altered by chromosomal rearrangements, a common feature in AML. They then combined these data with information on health outcomes and the physical features of each patient’s cancer.
Além de confirmar subtipos genéticos conhecidos causados por lesões cromossômicas ou mutações, os resultados lançam luz sobre associações até então desconhecidas. Por exemplo, os pesquisadores encontraram pares de alterações genéticas que parecem mudar o prognóstico de um paciente quando ocorrem juntas, como mutações combinatórias em NPM1 e genes da coesina que conferem bom prognóstico. Por outro lado, mutações e variantes estruturais de RUNX1 em associação com a superexpressão de MN1 têm um resultado muito ruim. Eles também descobriram semelhanças genéticas inesperadas entre cânceres que são morfologicamente diferentes uns dos outros, ressaltando como a análise genética combinada com abordagens padrão fornece um quadro mais completo do que a análise da morfologia sozinha.
Esses insights têm implicações importantes para a pesquisa do câncer e tomada de decisão clínica, dizem os pesquisadores. Em um nível básico, ter uma referência genética semelhante a um dicionário para os subtipos de AML e MDS será útil para pesquisas futuras sobre como essas doenças se desenvolvem e como podem ser direcionadas com novos medicamentos. Do ponto de vista clínico, o estudo sugere que o sequenciamento do genoma completo não é apenas viável, mas útil para identificar subtipos de doenças e prognósticos, a fim de adaptar o curso do tratamento à doença de cada paciente - uma abordagem conhecida como medicina de precisão.
“Este é o tipo de conjunto de dados que será inestimável para os esforços da medicina de precisão”, disse o Dr. Iacobucci. “Como vimos em doenças malignas linfoides, o estudo mostra o poder do genoma integrado e do sequenciamento do transcriptoma para identificar novos subgrupos de doenças de importância clínica não evidentes na análise patológica e molecular convencional.”
Pesquisadores do Laboratório de Leucemia de Munique sequenciaram recentemente DNA e RNA de mais de 4.500 pacientes como parte de um esforço mais amplo para mover o genoma inteiro e o sequenciamento do transcriptoma do laboratório para a clínica para diagnóstico e tratamento direcionado.
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